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貝全安?全外顯子組檢測

全面、快速、精準(zhǔn)的產(chǎn)前全外單基因病診斷綜合服務(wù)

貝全安全外顯子組檢測

產(chǎn)前超聲異常胎兒,以往通常采用核型分析進(jìn)行遺傳病診斷,其診斷率為30%左右,而后續(xù)通過基因組拷貝數(shù)變異測序(CNV-seq)等技術(shù)也僅提高了約6%的診斷率(Petrovski et al., 2019)。這意味著仍有許多其他超聲異常的病例存在,且未檢出的病例僅能依靠有限的信息進(jìn)行遺傳咨詢,無疑使醫(yī)生與準(zhǔn)父母面臨著巨大挑戰(zhàn)。

2020年01月,ACMG發(fā)出胎兒外顯子組檢測技術(shù)在產(chǎn)前診斷中的臨床應(yīng)用意見(Monaghan K G et al., 2020) ,從應(yīng)用場景、檢測策略、報告周期、報告變異范圍、檢測前后的遺傳咨詢等多方面內(nèi)容做了詳細(xì)的闡述和指導(dǎo)建議。同年09月,為了規(guī)范、推進(jìn)我國產(chǎn)前外顯子組測序技術(shù)的臨床應(yīng)用,提升產(chǎn)前遺傳咨詢水平和質(zhì)量,我國團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)《產(chǎn)前外顯子組測序遺傳咨詢和報告規(guī)范》相應(yīng)出臺。

適用人群

● 超聲結(jié)構(gòu)異常,單一或多系統(tǒng)

● NT增厚(≥3.0mm)

● 重度胎兒宮內(nèi)生長發(fā)育受限(FGR,小于第10百分位數(shù))、胎兒嚴(yán)重貧血

● 重度羊水過多(羊水最大暗區(qū)>15cm或羊水指數(shù)>45cm)、羊水過少(羊水最大暗區(qū)≤2cm或羊水指數(shù)≤5cm)、雙側(cè)腦室增寬(10-15mm)、腦積水/腦水腫,胎兒水腫等異常情況

● 多發(fā)流產(chǎn),流產(chǎn)原因不明的流產(chǎn)組織, 為提高診斷效能,建議采用貝全安® + 科諾安® 聯(lián)合檢測

產(chǎn)品優(yōu)勢
分析全面

NanoWES探針覆蓋約25,000個基因,明確致病調(diào)控元件及內(nèi)含子區(qū)域,線粒體基因組等。結(jié)合CNV-seq,覆蓋SNP、Indel、CNV、非整倍體、嵌合體、LOH/UPD等多種變異類型

周轉(zhuǎn)時間(TAT)短

2-3周完成超聲結(jié)構(gòu)異常胎兒的全面遺傳學(xué)診斷。 Trio-WES 變異位點家系成員驗證,縮短報告周期(Sanger驗證一致率>99.9%)

結(jié)果精準(zhǔn)

PCR-free 預(yù)文庫構(gòu)建,探針1捕1捕獲,數(shù)據(jù)均一性高 Trio-WES精準(zhǔn)識別新發(fā)突變,可在一次檢測中完成家系共分離分析

全流程高質(zhì)量服務(wù)

Verita Trekker ?變異位點檢測系統(tǒng)、Enliven?變異位點注釋系統(tǒng)、Cruxome?數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)和NLPearlTM智能數(shù)據(jù)挖掘為一體的WES大數(shù)據(jù)分析與管理平臺體系。強(qiáng)大的信息分析、解讀和遺傳咨詢團(tuán)隊,提供全鏈條高質(zhì)量服務(wù)

案例分享
臨床信息

孕婦,32歲,孕12周就診,超聲提示胎兒頸部透明層厚度(NT)5.7mm  

不良孕產(chǎn)史:

2018年妊娠12周+5天,超聲提示NT值5.1mm 孕18周,經(jīng)羊水產(chǎn)前診斷:染色體核型分析正常,CNV-seq未見明顯異常; 孕24周,B超提示既往胎兒左頸后皮下可見一囊性包塊,大小17×16×10mm,邊界清晰,內(nèi)透聲尚可,考慮淋巴管瘤可能,胎兒雙足呈內(nèi)翻姿勢; 孕28周,超聲提示胎兒雙頂徑76mm,頭圍272mm,腹圍235mm,股骨長52mm,頸后17×7mm液相暗區(qū),胎兒雙足內(nèi)翻,羊水過多(羊水指數(shù)283mm); 孕32周,胎兒早產(chǎn)夭折(診斷重度窒息新生兒),具體病因不詳。

檢測結(jié)果

臨床醫(yī)生在了解了孕婦情況后,推測該孕婦NT增厚的情況與遺傳因素相關(guān)的可能性較大。在通過溝通拿到前一胎的DNA標(biāo)本后,臨床醫(yī)生便將其與孕婦夫妻二人的DNA樣本一起進(jìn)行了家系全外顯子測序(WES)。根據(jù)檢測報告顯示,在前一胎的DNA樣本中檢測到其2號染色體NEB基因存在兩個變異位點,一個來自父親c.4255-c.4256的雜合缺失變異,一個來自母親c.18366+2T>C的剪接位點變異,該基因變異與常染色體隱性遺傳疾病線狀體肌病2型(Nemaline myopathy 2, autosomal recessive)相關(guān)。根據(jù)ACMG指南及臨床表型綜合判定,該家庭早夭胎兒為線狀體肌病2型患者。

 

為了進(jìn)一步確定此次胎兒情況,臨床醫(yī)生將胎兒樣本同步送檢染色體核型分析、CNV-seq及WES。結(jié)果不出所料,此次胎兒與早夭胎兒一樣,核型及CNV-seq未見異常,但出現(xiàn)了NEB基因c.4255_4256del(雜合)及c.18366+2T>C(雜合)突變。

 

在經(jīng)過了臨床醫(yī)生的遺傳咨詢后,該孕婦選擇終止妊娠。

 

案例點評

隨檢測技術(shù)不斷進(jìn)展,許多常見胎兒指標(biāo)異常的病因不斷打破我們的常規(guī)認(rèn)識,NT增厚不再僅僅局限于三體綜合征等染色體疾病,一些單基因遺傳病也可能會出現(xiàn)類似的表型,臨床可采用多種方法查明病因。

 

另外,NT增厚是要直接做測序,還是要等后面的B超結(jié)果出來再進(jìn)行基因檢測,還需要臨床醫(yī)生進(jìn)一步思考。臨床醫(yī)生需做好遺傳咨詢工作,和患者明確,有多少疾病是基因檢測可以測出來而B超檢查不出來的,這樣可以為患者爭取更多的寶貴時間。

 

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